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fusioncatcher

  • 2024年5月19日
  • 2025年3月25日

RNAシークエンス解析関連のおすすめライブラリ

日付;2024/05/19(日) 何かの標的分子と疾患との関連を知りたい場合、結局のところ通常のRNA-seqなどを利用する場合が多い。なので、一般的な遺伝子発現解析ツールも準備する必要がある。最近ではRNA-seqもかなり普通になってきたので、以下のライブラリで通常のことは出来るように思う。ちなみに、以下のソフトを使った解析で一貫性のある結果が得られた場合、それは生物学的に有意であり、すぐにでも […]

  • 2022年8月22日
  • 2025年9月9日

WSL2上のUbuntuにRNA-seq解析用のソフトをインストールする

日付;2022/08/22(月)日付;2025/09/09(火)ngs_disambiguateについて追記 これまでにWindows 11のWindows subsystems for Linux(wsl、バージョン2; wsl2)にUbuntu(20.04)をインストールしたので、 今回はRNA-seqの解析で、特にリードのフィルタリング、リファレンスシークエンス、マッピング、いわゆるプリプロ […]