fusioncatcher

• 2024年5月19日
• 2026年8月13日

RNAシークエンス解析関連のおすすめパッケージ

2024/05/19（日）；初稿2026/08/13（木）；タイトル訂正 何かの標的分子と疾患との関連を知りたい場合、結局のところ通常のRNA-seqなどを利用する場合が多い。なので、一般的な遺伝子発現解析ツールも準備する必要がある。最近ではRNA-seqもかなり普通になってきたので、以下のライブラリで通常のことは出来るように思う。ちなみに、以下のソフトを使った解析で一貫性のある結果が得られた場合 […]

• 2022年8月22日
• 2025年9月9日

WSL2上のUbuntuにRNA-seq解析用のソフトをインストールする

日付；2022/08/22（月）日付；2025/09/09（火）ngs_disambiguateについて追記 これまでにWindows 11のWindows subsystems for Linux（wsl、バージョン2; wsl2）にUbuntu（20.04）をインストールしたので、 今回はRNA-seqの解析で、特にリードのフィルタリング、リファレンスシークエンス、マッピング、いわゆるプリプロ […]