slingshot

• 2026年9月19日
• 2026年9月28日

PythonとRによるシングルセルRNAシークエンスの解析（DEG解析なし）

2026/09/19（日）；初稿 はじめに 最近はシングルセルRNAシークエンスも一般的な解析技術になってきた。それ単発の解析では、もうFigureを一つしか作れないような状態であり、空間トランスクリプトームや他のモダリティー（技術や手法）と合わせて、マルチオミクスという形で着目する現象を解明していく、というストラテジーが必要と言える。逆に言えば、シングルセルRNAシークエンスの解析は、もはやスタ […]

• 2024年4月28日
• 2026年8月13日

シングルセルRNAシークエンス解析で使用するおすすめRパッケージ

2024/04/28（日）；初稿2026/08/13（木）；タイトル訂正 先日にPythonを用いたシングルセルRNAシークエンス（scRNA-seq）解析のためのパッケージをインストールした。その記事はここに記したので、PythonでシングルセルRNAシークエンスのデータを解析したい方は、それを参考にしていただきたい。Pythonのパッケージは比較的（最近ではもう随分と安定してきたように思う。だ […]