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• 2026年5月11日
• 2026年5月11日

CPTACのデータとRを使ってがんや腫瘍のタンパク質発現量と患者の生存率の関係を解析する（CPTAC, v.4.4, 2024） 

2026/05/11（月）；初稿 はじめに これまでTCGA（The Cancer Genome Atlas）に登録された各種がんの遺伝子発現プロファイルと、その患者の生存率（生存期間）を解析してきた。この記事ではCPTAC（Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium）に登録されたデータを使ってがんや腫瘍のタンパク質発現プロファイルとその疾患の臨床情報 […]

• 2024年6月23日
• 2026年1月7日

RによるssGSEA（single sample Gene Set Enrichment Analysis）とその方法

日付；2024/06/23（日）、2025/04/03（木）ssGSEA2に使用するGCTファイルについて追記 はじめに これまでにBroad instituteのGSEAによりGSEAを行う方法をそれぞれ複数サンプルからなる2群間比較の場合と1群のみの場合について書いたが、ここではRを使ってsingle sample GSEA（ssGSEA）する方法を述べる。ちなみに、以前書いたBroad in […]