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バイオリンプロット

  • 2026年5月11日
  • 2026年6月13日

CPTACのデータとRを使ってがんや腫瘍のタンパク質発現量と患者の生存率の関係を解析する(CPTAC, v.4.4, 2024) 

2026/05/11(月);初稿2026/06/13(土);記事が長すぎてCodecプラグインが動かなかったので、コードをSTORESで販売することにした。 はじめに これまでTCGA(The Cancer Genome Atlas)に登録された各種がんの遺伝子発現プロファイルと、その患者の生存率(生存期間)を解析してきた。この記事ではCPTAC(Clinical Proteomic Tumor […]

  • 2025年12月14日
  • 2026年6月13日

TCGAのデータとRを使ってがんや腫瘍の遺伝子発現量と患者の生存率の関係を解析する(TCGA, v.43, 2025)

2026/01/03(土);初稿2026/01/12(月);追記;AnndataではなくSummerizeExperimentやMultipleAssayExperimentが使えると思う。2026/06/13(土);記事が長すぎてCodecプラグインが動かなかったので、コードをSTORESで販売することにした。 はじめに 以前、TCGAのデータを使って、がんや腫瘍における遺伝子発現量(RNA-s […]

  • 2025年12月14日
  • 2026年6月14日

TCGAのデータとRを使ってがんや腫瘍の遺伝子発現量と患者の生存率の関係を解析する(TCGA, v.41, 2024)

2025/12/14(日);初稿2025/12/29(月);訂正;カプランマイヤー法による生存率の解析;教科書(生存期間解析、ISBN978-4-254-12861-1)に従って、打ち切りの設定を確認し、生存曲線(カプランマイヤー推定値)の横軸を1825日(5年)に限定した。2026/01/03(土);訂正;元の記事のタイトル「TCGAのデータとRを使ってがんや腫瘍の遺伝子発現量と患者の生存率の関 […]