VirtualBox中のDebian 9に基本的なソフトをインストールする

日付;2021/05/02(日) Dell Precision M4800がぶっ壊れた(より正しくいえば、たまにしか起動しない)ので、予備としてVirtualBoxにそれをカバーするシステムを入れようと思う。今回は、必要と思われるソフトをインストールしていく。 1.sources.listの編集 sugedit /etc/apt/sources.list で、CD-ROMへの参照を削除 apt-g […]

VirtualBaxにDebian 9をインストールする

日付;2021/05/02(日) RNA-seq解析用の Dell Precision M4800が瀕死である。今後のRNA-seq解析に備えて、VirtualBoxにM4800をカバーできるまでの環境を立ち上げようと思う。 1. VirtualBoxのインストール まず、VirtualBoxをダウンロードし、インストールする。 2. Debian 9をインストール 次に、Debian 9をVir […]

Dell Precision M4800がぶっ壊れた

日付;2021/05/01(土) 最近、ボスが助成金獲得に尽力しているようだが、これに自分の解析したRNA-seqの結果を出すと言っている。随分前の話になってしまうが、そのために色々とグラフを作ってきた。しかし、このボス、どうも自分の解析を信用していないようだ。この理由の一つはおそらく、自分はバイオインフォマティシャンではないため、もう一つは、ボス自身がほとんどコンピューター解析(バイオインフォマ […]

電子天秤をぶっ壊した

2021/04/21(水) この日、もう勘弁してほしいと思わせてくれることが起きた。 タイトル通り、現ボスが電子天秤をぶっ壊した。これで薬剤の量とかを測っていたので、マジで面倒くさい。特に現所属のラボは、動物実験に使う試薬を、使う分だけその直前に測定してバイアルから採ってから使用する、ということをやっている。この時点で、あれっと思うが。なので、電子天秤が壊れることは結構なダメージである。それに加え […]

ブロッキングに用いるスキムミルクとBSA

日付;2021/04/06(火) 先週に細胞の準備が整い、現在行っている論文を改訂するためのウェスタンブロットが先週の金曜日から始まっている。このウェスタン、どうも結果に差がないように思うのだが、どうなんだろうか。そもそも、二回目のレビューアーからの要求は、すでにそのときの実験で解決してあり、今回は「実はこうしてほしかった。」という感じの要求なので、いくらでも「前回までの要求にはすでに答えている。 […]

最近の論文投稿に必要なデータの管理方法

日付;2021/03/31(水) 現在、おそらく最後になるはずの論文原稿の改定を行っているところである(もしかしたら、この改定のあとにリジェクトなんてこともあり得るのでなんとも言えない)。レビューアーとエディターからのリクエストのうち、主に論文の図に関係してくる以下の2つについて作業を行っている。これ以外、ほとんどなにもやっていない。 あと、これは特にエディターからのリクエストには載っていなかった […]

レビュー依頼(2021年その2)

日付;2021/03/26(金) 今日、またレビューの依頼が来た。レビューの依頼が来るとまるで認められたようでちょっと嬉しくなるが、同時に粗悪研究のレビューは嫌だという憂鬱な思いも生じてくる。 今回はPubmedにもJournal Citation ReportにもDirectory of Open Access Journalにも乗っているジャーナルだ。これは自分が世話になった(と勝手に考えてい […]

PI(ボス)について思うこと(その2)

日付;2021/03/26(金) 現在、投稿中の論文の再々々投稿に向けて色々と準備をしているところであるが、その作業中、PI(ボス)というかラボについて思ったことがあるので、それらを個人的に記しておこうと思う。これは個人的な考えなので、全てに当てはまるということはないだろう。 この再々々投稿中、あまり冷静ではない(経験がないから?)うちのボスが、何をしでかすかわからないという意味でかなり心配だ。 […]

再々々改定

日付;2021/03/25(木) おいおい。3回目。昨日(2021年3月24日)、投稿中の論文のエディターから返信があった(責任著者から転送されてきた)。 1つ目の要求は、実はなんとなく予測していた。来そうだなぁと思っていた。これについてはおそらくこちら側の否であろう。なぜうちのボスはあんなに焦って再投稿してしまったのだろう。ボスのボスの指示か、グラントのためか。もう一度投稿する羽目になったので、 […]

PI(ボス)について思うこと(その1)

日付;2021/03/19(金) 今日のミーティングはけっこう酷かった気がする。自分の発表ではなく、別のポスドクの発表だったが、聞いていてやれやれと思った。このミーティングに参加していると、「大丈夫か…」といつも思う。 発表のド頭で、進行を止められて、「この研究の最終目的と、そのための手段について」を最初から全部言わされていた。なんて無駄な….いつもいつも帰り際に何を喋ってるんだろう。そのときに話 […]